Nemocnica Bory bude v rámci onkologického programu poskytovať všeobecnú starostlivosť o onkologických pacientov. Zároveň sa chce stať aj koncovým pracoviskom pre liečbu niektorých typov karcinómov, predovšetkým nádorov pečene, žlčových ciest, pankreasu, prostaty, nervového systému či prsníka. Onkologický program bude zahŕňať všetky základné druhy onkologickej liečby, čiže chirurgiu, rádioterapiu a chemoterapiu.